Гени можна заглушити молекули miRNA, які викликають ендонуклеатичне розщеплення цільових молекул мРНК, або молекули мікроРНК, які пригнічують трансляцію молекули мРНК. З розщепленням або репресією трансляції молекул мРНК гени, які їх утворюють, стають практично неактивними.
Заглушення генів може бути результатом повторне метилювання ДНК. (A) За певних обставин (наприклад, у премейотичних клітинах Neurospora та Ascobolus) поєднання незв’язаних (або пов’язаних) неметильованих гомологічних послідовностей (сині сегменти) викликає метилювання de novo (червоні сегменти).
Таким чином, тиха мутація є точковою мутацією, де один нуклеотид у генетичній послідовності замінюється іншим нуклеотидом, змінюючи відповідний кодон на інший кодон для тієї самої амінокислоти.
Замовчування генів може бути досягнуто різними шляхами, включаючи використання РНК і антисмислової РНК, рибозимів тощо. Усі ці механізми переривають або пригнічують експресію генів на рівні транскрипції або трансляції.
У цьому контексті «замовчування» означає тимчасове блокування повідомлення певного гена, яке інакше могло б викликати небажаний ефект. Існує кілька різних типів методів глушіння генів. Silence Therapeutics зосереджується на біологічному процесі під назвою РНК-інтерференція.
Геноспецифічна деградація мРНК є одним із способів заглушити індивідуальну експресію генів після транскрипції. Однією з найбільш широко використовуваних технологій для індукції такої генно-специфічної деградації РНК є використання технології РНК-інтерференції (RNAi).