Додецилсульфат натрію (SDS) розчиняє фосфоліпідні та білкові компоненти клітинної мембрани, що призводить до лізису та вивільнення вмісту клітини. NaOH денатурує хромосомну і плазмідну ДНК, а також білки. Присутність РНКази А забезпечує перетравлення звільненої клітинної РНК під час лізису.
SDS солюбілізує клітинну мембрану. NaOH допомагає руйнувати клітинну стінку, але, що більш важливо, він порушує водневий зв’язок між основами ДНК, перетворюючи дволанцюгову ДНК (dsDNA) у клітині, включаючи геномну ДНК (gDNA) і вашу плазміду, на одноланцюгову ДНК. багатоланцюгова ДНК (ssDNA).
Бактеріальні клітини лізуються за допомогою додецилсульфату натрію (SDS) завдяки солюбілізації вмісту фосфоліпідів і білків клітинної мембрани, тоді як гідроксид натрію викликає денатурацію геномної ДНК, а також клітинних білків.
Буфер для лізису складається з гідроксиду натрію та додецилсульфату натрію (SDS). Іон OH− реагує з клітинною мембраною та розриває зв’язки жирної кислоти та ефіру гліцерину, а потім робить клітинну мембрану проникною, а SDS розчиняє білки та мембрану.
Крок 2: – "SDS є ключовим компонентом у вилученні ДНК, оскільки він сприяє лізису клітин і вивільненню геномної ДНК з різних типів зразків" . – "Він використовується в різних концентраціях і в поєднанні з іншими реагентами для оптимізації виходу та чистоти ДНК" .
NaOH буде денатурують ДНК і частково гідролізують РНК. SDS є дуже потужним іонним миючим засобом, який розчиняє мембрани та денатурує білки. Осадіть SDS-білок/клітинний дебрис високою концентрацією ацетату натрію або калію з низьким рН (4,8 – 5,2); K- або додецилсульфат Na в основному нерозчинний у воді.