довідка
| Введення/виведення Читання та запис загальних типів біомолекулярних даних | |
|---|---|
| plot(<cna>) plot(<ecna>) | Графики мережі білкової структури в 2D і 3D. |
| print(<cna>) summary(<cna>) | Узагальніть і надрукуйте характеристики мережевого графіка cna |
| ідентифікувати (<cna>) | Визначте точки на мережевому графіку структури білка CNA |
У R GUI виберіть «Пакунки та дані» → «Інсталятор пакетів» → «Локальний вихідний пакет» і натисніть кнопку «Встановити». Виберіть файл Bio3D tar і натисніть «Відкрити». У RStudio виберіть «Інструменти» → «Встановити пакети». Введіть bio3d у текстовому полі «Пакунки», переконайтеся, що вибрано «Залежності», і натисніть «Встановити».
Білкам потрібна тривимірна структура, оскільки вони діють як ферменти та будівельні блоки для клітин. Білки виконують важливу функцію як структурні одиниці клітин. Подібно до того, як цегла має певну форму, щоб забезпечити структуру наших домівок, білки мають певну форму, щоб забезпечити структуру клітин.
Біологічна функція білка визначається розташуванням атомів у тривимірній структурі. Це може бути розташування каталітичних залишків в активному центрі або те, як білок взаємодіє з іншими білками для структурних чи інших регуляторних цілей.
13. Як цитувати Bio3D-web?
- Skjaerven та ін. Онлайн-інтерактивний аналіз ансамблів структури білків за допомогою Bio3D-web (2016) Біоінформатика 32(22), 3510—3512. …
- Грант та ін. Bio3D: пакет R для порівняльного аналізу білкових структур (2006) Біоінформатика 22, 2695-2696.
- Skjaerven та ін.